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Mc-Sym est un logiciel de modélisation de structures
tri-dimentionnelles d'ARN qui utilise des coordonnées et
des relations entre résidus extraites de structures
cristallographiées, de résultats de RMN et de
modèles théoriques. Ces structures proviennent
des bases de données de RCSB Protein Data Bank et de
Rutgers Nucleic Acid
Database. Le modélisateur permet l'ajout de
contraintes à la procédure de construction afin
de générer des modèles valides. Les
instructions de construction et de contraintes peuvent
s'écrire dans un script ou être entrées
interactivement dans le modélisateur mcsym.
Mc-Sym 3.3.2 contient:
- mcsym le modélisateur;
- base de données mcsym
l'ensemble des résidus et des relations
entre les structures. Vous pouver obtenir la
dernière version de la base de
données à cette adresse;
- mcrms calcule la rmsd entre des
structures, ce programme permet aussi
d'aligner des structures;
- toleap / fromleap outils
de conversion entre le format pdb de
mcsym et le format pdb de leap.
Mc-Sym 3.3.2 est présentement
disponible pour les plateformes suivantes:
- Linux glibc 2.3
- IRIX 6.5
- SunOS 5.9
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Vous pouvez obtenir gratuitement et tester une version de
démonstration de Mc-Sym. Cette version limite la taille
des séquences d'ARN à 9 nucléotides.
Le Projet de Documentation
Pour obtenir la version complète de Mc-Sym 3.3.2.
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